祥興九年（1286）新年一過，宋軍再次擴軍。禁軍一師到四師被分別擴充為軍，分別以青龍白虎朱雀玄武為旗，而軍制也做了微調。
班：共12人，設正副班長
排：三個班，正副排長，共計38人。
連：三個排，一個特務班（含斥候、炊事、醫療、物資、通傳），正副連長，共計128人。
營：三個連，一個特務排（含斥候、炊事、醫療、物資、通傳），正副營長，一名警衛員，共計425人。
團：三個營，一個炮連，一個特務連（含斥候、炊事、醫療、物資、通傳），正副團長，團監，團參，三名警衛員。共計1500餘人。
旅：三個團，一個特務營（含斥候、炊事、醫療、物資、通傳、炮連），正副旅長，旅監，旅參，警衛班。共約5000人。
師：三個旅，一個騎兵團，一個特務團（含一個炮營，以及斥候、炊事、醫療、物資、通傳等），正副師長，正副師監，正副師參，參謀數人等，警衛排。共約一萬八千人。
軍：三個師，一個騎兵團，一個炮團，一個特務團（含斥候、炊事、醫療、物資、通傳等），正副軍長，正副軍監，正副軍參，參謀等，警衛連。共約六萬人。
擴軍後，兵部正副部長張世傑和劉蘇義分別被升銜為大將和上將，兵部參謀司潘舍人和陳道銘分任少將司長和大校副司長，潘龍任兵部政宣司少將將司長。
野戰部隊含青龍白虎朱雀玄武四軍，以及近衛師和騎兵師。
原近衛旅擴為近衛師，也稱6師，以麒麟為旗，由宗渡河任准將師長。
原第一師擴編為青龍軍，軍長中將張達，副軍長少將許漢升，軍監少將陳子敬，軍參准將校趙良鈐。下轄11師師長准將吳滿，12師師長大校戴耀祖，13師師長准將羅半天。
原第二師擴編為白虎軍，軍長中將陳吊眼，副軍長少將陸陪松，軍監少將何時，軍參准將林琦。下轄21師師長准將鄧榮，22師師長准將張飛，23師師長准將歐鐘。
原第三師擴編為朱雀軍，軍長少將馬南寶，副軍長少將魯河封，軍監少將胡文可，軍參准將符同信。下轄31師師長大校黃敬，32師師長大校吳重，33師師長大校洪戰青。(馬南寶部因在皋亭一戰中被伯顏援軍突破，自請處分，因而多人軍銜少升了一級。)
原第四師擴編為玄武軍，軍長中將鄭虎臣，副軍長少將歐南喜，軍監少將何平，軍參准將卓鬆口。下轄41師師長准將杜可用，42師師長准將羅火金，43師師長准將婁鈐度。
原騎兵旅擴編為騎兵師，也稱7師，以貔貅(pixiu)為旗，由王恨任少將師長，洪賢任准將師監。
禁軍滿編應為二十六七萬人。由於大戰剛過百廢待興，雖然編製擴充了，大多數部隊卻未在祥興九年立即滿員。只有馬南寶的朱雀軍在新年一過就被補充滿員六萬，並調入雲南進行叢林作戰訓練，祥興九年的黃埔六期畢業軍官也多分至朱雀軍。其他各部禁軍每班僅補充至一半人員，即6人。
廣東路（101旅）、廣西路（102旅）、福建路（103旅）、浙江路（104旅）、四川路（105旅）、荊湖路（106旅）、夔州路（107旅）、雲南路（108旅）各組建廂軍一個旅，分別由林桂華、白山、陳大婦、章炎、羅明復、文才喻、胡見復、楊培東等任大校或上校旅長。廂軍主要承擔本路防守之責，建制與禁軍略為不同，每個旅不是三個團而是六個團，有一萬人左右。事實上各地治安還是依靠當地民兵和警察，廂軍主要駐防於重點城市和關卡。
駐紮在濟州的邊軍211旅，由原副旅長鄒大力升任上校旅長，郭通任上校監軍；由於瓊州和台灣已經完全穩固，鎮戍台灣的邊軍222團將防務移交福建路廂軍旅的一個團，全軍北上至台灣島北端待命；鎮戍瓊州的邊軍221團將防務移交廣東路廂軍旅的一個團，而後北上接管長江入海口的崇明島等江中島嶼，這是宋軍乘元軍主力北撤奪占而來的。此時的崇明島尚未有七百年後的規模，而且分為互不相連的數島，島上的漁民也不多。
特軍基本還是原有架構，301團是侍衛團，負責保衛皇宮和皇帝，這個團在皋亭一戰中損失慘重，重建時陳濤源費了不少勁；302團為兵部直屬團；303團為朝廷各衙警衛團；304團和305團分別在廣州和泉州警衛軍械司和工部工藝坊的各處研究生產機構以及船廠；306團是新兵教導團，專門負責招收和培訓新兵；311，312，313三個營是武工營，專事在韃占區的破壞和發動百姓，西湖和約後除留下暗樁外，三個武工營都撤回整編，大多數補充入禁軍，剩下一些精幹合併為一個營進行整訓，由牟天祿少校率領，待機再潛往韃占區。
海軍也再次進行了整編，總兵力達五萬人。南海艦隊、東海艦隊、和巡獵艦隊依舊是海上主力艦隊，近年新增的四十丈以上，可容千人以上的大戰船都配至這三個艦隊。可惜鐵甲船還是未能投入使用，主要是動力不夠速度太慢，在我的啟發和推動下，軍械局和工部正在全力研製蒸氣機。
南海艦隊以鯨魚為旗，都統中將黎德，副都統少將陳植，監軍少將吳思齊兼參謀長，吳林、張龍、郭德磬分任一到三分艦隊准將都統。
東海艦隊以鯊魚為旗，都統中將方川德，副都統少將蔡梅生，監軍少將將方鳳，參謀長准將吳順，吳順（兼）、郭烽、李進財分任一到三分艦隊准將都統。
巡獵艦隊以信天翁為旗，都統少將沈洋，副都統准將田守德，監軍准將黃北望兼參謀長。
鎮戍濟州島的濟州艦隊以章魚為旗，由張虎任准將都統，柳華申任大校副都統，周仁奉任大校監軍。
新設立長江艦隊，以鱷魚為旗，南海東海巡獵三大艦隊最近換下來的主要戰船都被歸入長江艦隊。由原東海艦隊副都統張之雄任長江艦隊少將都統，副都統准將韓無雙，監軍准將杜行兼參謀長。長江艦隊主力在健康，其餘分佈在長江入海口崇明島到江陵一帶的長江南岸的幾個基地上，任務就是打擊北岸沿江一線的元軍，特別是造船坊或回回炮陣地。長江艦隊從人數和船隻數量而言是海軍中最龐大的，有近二萬人和一百多條戰船。
五個艦隊每個艦隊均配有一個團的陸戰隊.
祥興九年的宋境就像一個大工地，到處在修路開田辦工坊，這也使得難民們能有活幹有飯吃。恢復民生發展經濟成了宋庭的首要大事，軍隊建設只能優先保證在雲南進行叢林訓練的朱雀軍和少數幾支有任務的隊伍，其它的就只能一步步來了。
在擴編過程中，貔貅師，也就是王恨的騎兵師遇到了一個大麻煩，那就是宋境根本無法提供足夠的合格戰馬。雖然近年與元軍的作戰不斷有所繳獲，己方戰馬的損耗也很大，加上傷病老弱，雖有濟州島等地馬場的補充，還是遠遠不夠。若是配齊一萬八千人的編制，至少需要四萬到五萬匹戰馬，加上其他各部所需（每個師和軍都有騎兵團），八到十萬匹戰馬是宋軍的底線。然而此時宋軍滿打滿算也僅有二萬匹戰馬，還包括些老弱。
為了解決這個問題，商部下屬華夏公司和泉州的林光達以及原利州西路的馬商魏人傑三方合資了一個商行，叫川北商行。由魏人傑負責打通與蒙古汗國之一的窩闊台國海都控制區的貿易聯繫以換取戰馬，此時海都的軍隊已經拿下瓜州（敦煌東）、肅州（甘肅酒泉）、甘州（張掖）、涼州（武威）、中興府（銀川）、夏州（陝西橫山西）一線，西寧州也落入海都之手，海都和宋境間只隔著臨洮路還在元軍控制之下。
魏人傑帶著馬隊，裝載著少量玻璃、鏡子、蒸酒、角皂等生活奢侈品，向西進入吐蕃，繞過臨洮路，沿著黃河好不容易到了西寧。和忽必烈多用回人為自己處理貿易事宜不一樣，海都的窩闊台國中，貿易上雖然也依靠回人，拿主意的還是蒙古人，儘管他們自己常常數不到一百。魏人傑所攜帶的大部分物品並未象事先期望的那樣大受歡迎，海都這裡的蒙古人更多地保留著他們遊牧荒原的習氣，一年洗不了幾次澡，角皂就無太大吸引力；西北風沙甚大，玻璃太易破碎，也不怎麼太實用，鏡子倒是有些市場，但那裡的女子每日風沙洗面姿色有限，主要市場在達官貴人家裡。只有蒸酒大受歡迎，喝貫了膻腥的馬奶酒，蒙古人視蒸酒為天液。
蒙古人並不習慣做生意，看到好東西最直接的做法就是去搶。所以開始魏人傑並未談妥什麼生意。此時海都在前方捷報頻傳，西寧的蒙古人認為只要擊敗忽必烈，中國的一切就會全部屬於自己，又何必用寶貴的戰馬去換？
祥興九年初夏的太原城下，忽必烈和海都展開了決定性的一役，海都方面以十數萬大軍圍攻太原城，元將李庭依城死守，海都數十日攻擊未果，結果伯顏率十萬元軍趕到，和李庭內外夾擊海都。多日鏖戰後，將海都大軍擊潰，已經前至大都附近大同府的那支海都偏師後路已斷也不得不北繞撤回中興府。忽必烈傾全國之力解了太原之圍後，又借勢奪回了夏州，卻在中興府下遭遇海都強烈抵禦，雙方呈膠著狀態。
忽必烈畢竟有蒙古「大汗」之名，他派出各路使臣，向幾大汗國和各處王公施加壓力，誘之以利，一些原本同情海都的開始轉向中立，有些參與出兵的王公藉故抽回本部，海都的形勢漸趨不利，軍械糧食供應也出現了問題，可他又不甘心放棄好不容易奪得的土地向西退卻。
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